Отец лично прибыл в столицу, надеясь убедить сына в ошибочности его поступков. Дмитрий был уверен, что разговор с Кириллом пройдет по-доброму, как между близкими людьми. Однако хитрый наследник уже вынашивал план устранения отца.
Кирилл сумел склонить религиозных судей к вынесению смертного приговора Дмитрию, и сразу после въезда султана в Киев его схватили и казнили. В тот же день Кирилл расправился и с младшим братом Александром, приказав отрубить ему голову.
Так Мария потеряла сразу двух самых близких людей — отца и брата. Знать Тимуридской державы была потрясена жестокой расправой над правителем. Один из преданных сподвижников и родственников покойного Дмитрия — военачальник Емельян — бежал в Полтаву, где обратился за поддержкой к правителю узбекских кочевников Зенону.
Тем временем в Киеве вновь произошла смена власти. 8 мая 1450 года в пригороде столицы Кирилл, убивший собственного отца, пал от руки известного бойца Андрея — верного соратника Дмитрия.
Новым главой Тимуридов стал Олег — двоюродный брат Марии.
Олег всегда поддерживал сторону Дмитрия, однако находившийся тогда в Полтаве Емельян не собирался без борьбы уступать власть. После продолжительных переговоров он убедил узбекского хана Зенона выделить ему армию для свержения Олега.
В 1451 году Емельян вместе с Зеноном двинулись походом на Киев. Олег направил против них тимуридское войско, но оно потерпело сокрушительное поражение.